伊普西龙人自然不会为此处罚犯错的族人，因为“新人类”同样有好斗缺陷，难以令他们满意。
于是，在根达亚人与“新人类”后，“新新人类”与第三次文明出现在环境改造过后的穆利亚大陆，同多样化大爆发的植物共同生活。
穆利亚人的超能力再次被削弱，伊普西龙人这么做的初衷是为了让穆利亚人学会合作与包容，即便没有超能力也可以通过大自然的馈赠生活下去。
至于灵魂的容器嘛……根达亚人同穆利亚人结合，会激发DNA的隐藏片段，从而诞下纯粹的根达亚人。
经过三次文明变迁，伊普西龙人对于盖亚星生活的穆利亚人失去最初的博爱与宽容，变得严厉与苛刻。对于这一点，他们的根达亚子女很清楚，这种态度变化源于失望也好，源于失去新鲜感也罢，总之伊普西龙人越来越将引导盖亚星文明发展当成一个游戏，把穆利亚人看成容器供应者……就像……就像恶灵对人类身体的渴望。
当一个人获得了永恒的生命，免于死亡的恐惧，总要找点乐子来做，以度过漫长的岁月。
伊普西龙人对盖亚星生活的智慧种族的态度发生转变，他们的根达亚人子女对他们的态度随着时间推移也随之改变。从原来的感恩、尊敬到疑虑、不解，再到恐惧、愤恨……谁会愿意自己的孩子成为别人的意识容器呢，哪怕是赐予他们生命的人。
说起来，他们才是盖亚星的智慧生命，跟现在的穆利亚人一样。伊普西龙人才是外来者，这些外来者正在收起伪善面孔，露出邪恶的爪牙……起码在他们看来是这样。
穆利亚人还是被毁灭了，板块沉陷，海水没过大陆，文明就此失落。施暴者……正是伊普西龙人的根达亚人子女。
造成这一切的原因是，穆利亚人没有走上伊普西龙人乐见的道路，缺乏集体意识与奉献精神，在个性与思维上表现出差异化，而差异化正是带来分歧与混乱的根源。
对于伊普西龙人来讲，毁灭一个文明与重建一个文明就像重练一个小号般简单，可是对于一部分根达亚人子女来讲，毫无疑问是邪恶的，如同魔鬼。
当第四次文明在一个叫做亚特兰蒂斯的地方诞生时，伊普西龙人将这种轮回彻底当成了游戏。他们决定离开一段时间，没有说明去向，只是将引导文明发展的重任交给了根达亚人子女以及少数“沾亲带故”的穆利亚人。
等待是无聊的……没有一个人喜欢重新升级。
伊普西龙人在离开前肆无忌惮地调侃，猜想亚特兰蒂斯文明会以怎样的方式落幕。
他们不仅在对亚特兰蒂斯文明的态度上表现出不尊重，对于根达亚子女来讲，也失去和蔼一面，因为多数伊普西龙人主张启动克隆技术，用更为简单的方法获得年轻、健康的躯壳。
如果放在以前，对于他们的根达亚人子女来说，当不至于有多大触动。
今时不同往日，要知道智慧生物的思想随着时间推移，会不断成长，不断成熟。因为伊普西龙人的态度转变不断积累的愤怒，最终在根达亚人（在亚特兰蒂斯人面前自称为神使）群体造成意见分歧。
其中一部分根达亚人在对立者休眠时期通过隐蔽手段向亚特兰蒂斯人输送先进技术，催化科技发展。
当伊普西龙人归来，看到亚特兰蒂斯人已经初步进入太空文明，并拥有了源自伊普西龙技术的战斗舰只。他们明白自己受到欺骗，心中燃起愤怒的火焰。
对亚特兰蒂斯文明的毁灭之战拉开序幕，然而伊普西龙人很快发现一个令人震惊的事实……那些背叛者有外援，非常强大的外援。
虽然他们最终赢得了胜利，亚特兰蒂斯文明走向灭亡，盖亚星重归混沌。但是阿瑞斯星也变成一片废墟，沦为不毛之地。
按照库库尔坎的说法，反抗伊普西龙人的根达亚人与极少数穆利亚人在外援的帮助下逃了出去。当他们了解到失落之地发生的事情，偷偷回到盖亚星打探虚实的时候，伊普西龙人已经不在了。
不同于以前，这次伊普西龙彻底离开了，留下一个烂摊子。
随着伊普西龙人消失不见，曾经的分歧与龃龉也不复存在，根达亚人与穆利亚人开始改造环境，重建家园，培育文明火种。
人类……开始在星球各个区域出现，不再是以前的圈养状态。
根达亚人与穆利亚人从原来的神使一跃变成神明，叫人讽刺的情况出现了……他们最终变成近似伊普西龙人的存在，好在不是看过多次文明轮回，失去耐心与博爱的伊普西龙人。
他们融入社会，一方面监控文明发展，一方面引导文明发展……主要是压抑科技进步。这种情况没有持续多长时间，因为意见与主张的不统一，他们开始分裂，开始内讧，开始小动作不断。
起初保守派占据绝对优势，这在历史上表现为神权对王权的压制，君权对民权的压制。
开明派尝试打破这样的格局，于是有各种各样的思潮，各种各样的对抗。
美塞尼亚战争、特洛伊战争、罗马内战、十字军东征，乃至百家争鸣、文艺复兴，封建农奴制度的确立，资本主义的兴起……历史上很多著名势力战争、思潮对抗，工业革命都是在他们的操纵与影响下发展而成。
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